Asosiasi Prodi Ekonomi dan Jurusan Ekonomi Syariah lahir seiring bersamaan dengan lahirnya konsorsium prodi Ekonomi Syariah di bawah naungan Asosiasi Fakultas Ekonomi dan Bisnis Islam di bawah PTAIN. Konsorsium Prodi Ekonomi Syariah merupakan perkumpulan dari program studi-program studi Ekonomi syariah di bawah AFEBIS, yang dalam waktu yang sama ada permintaan dari prodi dan jurusan ekonomi syariah selain dari AFEBIS seperti yang lahir dari Fakultas Syariah, Fakultas Agama Islam dan berasal dari kampus swasta.